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Célya Gruson-Daniel

Researcher, HackYourPhD & Ancre des Savoirs co-founder, #Inno3 #Open_Science #Digital_Science, #Yoga

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PubPub : expérimentation éditoriale

Suite à la publication de l’ouvrage « Mind the Gap » qui dresse une analyse de l’usage d’outils/plateformes open source au sein de l’édition scientifique, j’ai découvert le site PubPub développée par le MIT. La plateforme elle-même en open source, permet de rédiger des «pub» (publications) et de les agencer de différentes manières. Les publications combinées peuvent ainsi donner lieu à un livre, servir de base à une revue ou bien être utilisées comme carnet de laboratoire ou billets d’une conférence.

PubPub se positionne avant tout comme une interface au service de communautés d’où une une dimension collaborative pour l’écriture et la relecture/review. Outre la possibilité de contribuer à plusieurs sur une même publication, il est également possible de commenter/annoter l’article. Autre fonctionnalité, le fait de pouvoir écrire directement en markdown. D’un point de vue technique, pour les habitué.e.s de git, la plateforme reprend les modalités de suivi de version (push/commit). Au niveau économique, il s’agit d’un modèle freemium offrant des fonctionnalités supplémentaires (nom de domaine propre, soutien ) pour répondre aux besoins d’instituts et de communautés. Le principe est aussi de faire payer la « fermeture » d’un contenu : publier sous licence CC0 ou CCBY est la référence et apposer une autre licence est payant. Un Bémol, j’aurais bien voulu que la licence CC-BY-SA soit aussi considérée comme option de base. PubPub propose aussi des fonctions propres à l’édition scientifique (DOI, metrics, etc.).

Voici pour la très brève description. Cet outil a répondu aux besoins que je me posais lors de la rédaction de ma thèse (écriture en markdown et commentaires possibles pour la relecture). L’été 2018, mon choix avait été de rédiger ma thèse en markdown avec Atom et un plugin Atom pour ajouter les références Zotero. Nénamoins, j’avais tout basculé sur Google Doc (export via Pandoc) pour faciliter la relecture collective. Démarche faite à contrecoeur car je souhaitais rester sur une chaine éditoriale ouverte.

À charge de revanche puisqu’un an après, j’ai, expérimenté PubPub afin de rendre plus accessible ma thèse (au delà du pdf bien décourageant ! ). J’ai crée un espace HackYourPhD en français et en anglais avec d’une part mes chapitres de thèse et d’autre part la rédaction de quelques articles de blog en lien avec son contenu.

Pour y accéder c’est ici. Les commentaires sont bienvenus !


PubPub : editorial experimentation

Following the publication of the book “Mind the Gap “ which analyses the use of open source tools/platforms within scientific publishing, I discovered the sitePubPub developed by the MIT. The Platform itself, in open source, allows to write “pub” (publications) and to organize them in different ways. Combined publications can thus be used as a book, as articles for a journal or as a laboratory notebook or conference notes.

PubPub is mainly described as an interface for communities, providing a collaborative dimension for writing and proofreading/reviewing. In addition to the possibility of multiple contributions to the same publication, it is also possible to comment on/annotate each publication. Another feature is the ability to write directly in markdown. From a technical point of view, for git users, the platform includes a version control system (push/commit). Economically, it is a freemium model offering additional functionalities (own domain name, support, etc.) to meet the needs of institutes and communities. The principle is also to charge for “closing” a content: publishing under a CC0 or CCBY license is the reference and adding another license is charged. One downside, I would have liked the CC-BY-SA license to be considered as a basic option as well. PubPub also offers functions specific to scientific publishing (DOI, metrics, etc.).

Here is for the very brief description. This tool meets the needs I had when writing my thesis (writing in markdown and possible comments for proofreading). In the summer of 2018 my choice was to write my thesis in markdown with Atom and an Atom plugin to add Zotero references. Nevertheless, I had switched everything to Google Doc (export via Pandoc) to facilitate collective proofreading. This was done reluctantly because I wanted to stay on an open editorial channel.

On return, since one year later, I experimented with PubPub to make my thesis more accessible (beyond the discouraging pdf!). I created a HackYourPhD space in French and English with on the one hand my thesis chapters and on the other hand the writing of some blog articles related to its content.

To access it, it ishere. Comments are welcome!